पल्मोनरी एम्बोलिज्म आमतौर पर तीन प्राथमिक कारकों की परस्पर क्रिया से उत्पन्न होता है, जिन्हें अक्सर विर्चोव के ट्रायड के रूप में जाना जाता है:
1. एंडोथेलियल चोट: रक्त वाहिकाओं की आंतरिक परत, एंडोथेलियम को ​​नुकसान।
2. शिरापरक ठहराव (वेनस स्टैसिस): नसों के भीतर रक्त प्रवाह का रुकना या धीमा होना।
3. हाइपरकोगुलेबिलिटी: रक्त के जमने की प्रवृत्ति में वृद्धि।

ये स्थितियाँ अक्सर रक्त के थक्के (थ्रोम्बस) के निर्माण का कारण बनती हैं, जो सबसे अधिक निचले अंगों (पैरों और तलवों) की गहरी नसों में या कम बार पेल्विक/पेट के क्षेत्र में होता है। यह थ्रोम्बस टूट कर रक्तप्रवाह के माध्यम से यात्रा कर सकता है, जिससे हृदय के दाहिने वेंट्रिकल तक पहुँच सकता है। वहाँ से, इसे पल्मोनरी धमनियों में पंप किया जाता है, अंततः फेफड़ों में जमा हो जाता है और पल्मोनरी एम्बोलिज्म का कारण बनता है।

फेफड़ों तक पहुँचने पर, थक्का एक या एक से अधिक पल्मोनरी धमनियों को बाधित करता है, जिससे प्रभावित फेफड़ों के ऊतक में रक्त प्रवाह बाधित होता है। पल्मोनरी एम्बोलिज्म की गंभीरता सीधे थक्के के आकार और बाधित वाहिकाओं की संख्या और कैलिबर से संबंधित होती है।