गर्भावस्था के दौरान आमतौर पर एलर्जी वैक्सीन का उपचार शुरू नहीं किया जाता है। हालांकि, यदि एलर्जी वैक्सीन का उपचार गर्भावस्था से पहले शुरू किया गया था और उपचार के दौरान गर्भावस्था हुई, तो रोगी के साथ विस्तृत चर्चा की जाती है। इस चर्चा के दौरान, उपचार जारी रखने या बंद करने के संभावित जोखिमों और लाभों का मूल्यांकन करते हुए एक व्यक्तिगत जोखिम-लाभ विश्लेषण किया जाता है। इस विश्लेषण के परिणाम के आधार पर, उपचार जारी रखने या रोकने का निर्णय रोगी के साथ मिलकर लिया जाता है।