जबकि बोन मैरो बायोप्सी को आमतौर पर बड़ी जटिलताओं की कम घटना के साथ एक सुरक्षित प्रक्रिया माना जाता है, किसी भी चिकित्सा हस्तक्षेप की तरह, इसमें कुछ संभावित जोखिम होते हैं। ये जटिलताएं आमतौर पर दुर्लभ होती हैं और इनमें शामिल हो सकती हैं:
* हड्डी में फ्रैक्चर या दरारें: यद्यपि बहुत दुर्लभ है, सुई का हड्डी में प्रवेश कभी-कभी मामूली हड्डी फ्रैक्चर या दरारें पैदा कर सकता है।
* रक्तस्राव: बायोप्सी स्थल पर न्यूनतम रक्तस्राव सामान्य है। हालांकि, दुर्लभ मामलों में, प्रक्रिया के बाद महत्वपूर्ण रक्तस्राव हो सकता है, जिसके लिए चिकित्सा हस्तक्षेप की आवश्यकता हो सकती है।
* संक्रमण: बायोप्सी स्थल पर संक्रमण एक दुर्लभ लेकिन संभावित जटिलता है।
* सुई का टूटना: अत्यंत दुर्लभ रूप से, प्रक्रिया के दौरान बायोप्सी सुई टूट सकती है।
* एलर्जी प्रतिक्रियाएं: चूंकि बोन मैरो बायोप्सी अक्सर बेहोशी की दवा (सेडेशन) के तहत की जाती है, इसलिए बेहोशी की दवा के लिए उपयोग की जाने वाली दवाओं के प्रति एलर्जी प्रतिक्रियाएं भी एक दुर्लभ लेकिन संभावित जोखिम हैं।