बोन मैरो कैंसर का उपचार प्रत्येक रोगी के लिए अत्यधिक व्यक्तिगत होता है और कैंसर के प्रकार, चरण, फैलाव और रोगी के सामान्य स्वास्थ्य सहित कई कारकों पर निर्भर करता है। उपचार के प्राथमिक लक्ष्यों में कैंसर को ठीक करना, उसकी प्रगति को रोकना या विलंबित करना, या लक्षणों को कम करके जीवन की गुणवत्ता में सुधार करना शामिल हो सकता है। रक्त या बोन मैरो में असामान्य कोशिकाओं का पता न चलने की स्थिति को छूट (remission) कहा जाता है।

बोन मैरो कैंसर के उपचार के मुख्य तरीके निम्नलिखित हैं:

* कीमोथेरेपी: यह एक दवा उपचार है जिसका उद्देश्य कैंसर कोशिकाओं को मारना या उनके गुणन को रोकना है। विभिन्न कीमोथेरेपी दवाएं नसों के माध्यम से (इंट्रावेनस) या मुंह से (ओरल) दी जा सकती हैं।
* लक्षित थेरेपी (Targeted Therapies): ये ऐसी दवाएं हैं जिन्हें कैंसर कोशिकाओं के विकास और अस्तित्व के लिए जिम्मेदार विशिष्ट आनुवंशिक या आणविक तंत्रों, या इन कोशिकाओं की सतह पर मौजूद मार्करों को लक्षित करने के लिए विकसित किया गया है। इन उपचारों को भी दवा की प्रकृति के आधार पर मौखिक रूप से या अंतःशिरा द्वारा प्रशासित किया जा सकता है। प्रत्येक दवा के अपने अद्वितीय कार्यप्रणाली और संभावित दुष्प्रभाव होते हैं।
* स्टेम सेल प्रत्यारोपण: यह कुछ मामलों में एक उपचार विकल्प हो सकता है, लेकिन हर रोगी प्रत्यारोपण के लिए उपयुक्त नहीं होता है। विशेष रूप से तीव्र ल्यूकेमिया में, उच्च जोखिम वाले कारकों वाले रोगियों के लिए कीमोथेरेपी के बाद बोन मैरो के सामान्य होने पर स्टेम सेल प्रत्यारोपण की सिफारिश की जा सकती है। क्रोनिक ल्यूकेमिया में, प्रत्यारोपण शुरुआती उपचार विकल्प नहीं है और इसका मूल्यांकन बीमारी की प्रगति के आधार पर किया जाता है। प्रत्यारोपण से पहले, रोगी के मौजूदा बोन मैरो को दबाने या नष्ट करने के लिए उच्च खुराक वाली कीमोथेरेपी की आवश्यकता होती है।