कोलन कैंसर का शुरुआती पता लगाने में कोलोनोस्कोपी एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाती है। जिन व्यक्तियों में जोखिम कारक नहीं होते हैं, उनके लिए 45-50 वर्ष की आयु के बीच नियमित कोलोनोस्कोपी जांच शुरू करने की सलाह दी जाती है। हालांकि, जिन लोगों के परिवार में कोलन कैंसर का इतिहास रहा है या जिनमें अन्य उच्च जोखिम वाले कारक हैं, उन्हें कम उम्र में जांच शुरू करने की आवश्यकता हो सकती है। कोलोनोस्कोपी को दोहराने की आवृत्ति प्रक्रिया के निष्कर्षों और रोगी के व्यक्तिगत जोखिम कारकों के आधार पर भिन्न होती है। आम तौर पर, ऐसे मामलों में जहां कोई महत्वपूर्ण असामान्यता नहीं पाई जाती है या हटाए गए पॉलीप्स कम जोखिम वाले होते हैं, 5 साल के अंतराल पर फॉलो-अप कोलोनोस्कोपी की सिफारिश की जाती है। हालांकि, पॉलीप्स की संख्या, प्रकार और आकार, या कोलोनोस्कोपी के दौरान अपर्याप्त आंत्र तैयारी जैसे कारक फॉलो-अप की आवृत्ति को काफी प्रभावित करते हैं। ऐसी स्थितियों में जहां पूरी तरह से मूल्यांकन नहीं किया जा सका, एक वर्ष के भीतर दोबारा कोलोनोस्कोपी की आवश्यकता हो सकती है। अल्सरेटिव कोलाइटिस या क्रोहन रोग जैसे सूजन आंत्र रोगों वाले व्यक्तियों के लिए, कोलोनोस्कोपी फॉलो-अप की आवृत्ति उनके गैस्ट्रोएंटेरोलॉजिस्ट द्वारा व्यक्तिगत दृष्टिकोण के साथ निर्धारित की जानी चाहिए।