जब एक अनुभवी विशेषज्ञ द्वारा इमेजिंग मार्गदर्शन के साथ कोर सुई बायोप्सी की जाती है, तो जटिलताओं का जोखिम काफी कम होता है। शायद ही कभी देखे जाने वाले जटिलताओं में रक्तस्राव और न्यूमोथोरैक्स (फुफ्फुस झिल्ली के चारों ओर हवा का जमाव) शामिल हैं। ऐसी स्थितियाँ आमतौर पर किसी भी हस्तक्षेप की आवश्यकता के बिना स्वतः ही ठीक हो जाती हैं।