La colposcopie est généralement une procédure sûre et peut être répétée si nécessaire. Cependant, certains risques potentiels existent après une biopsie colposcopique, ou rarement, après une colposcopie seule. Ces effets secondaires possibles sont généralement légers et rares, mais peuvent inclure : Saignement, Infection, Fièvre élevée ou frissons, Écoulement vaginal abondant, jaune ou malodorant, Douleur abdominale basse.