Comme toute intervention chirurgicale, l'ablation d'une tumeur de Wilms comporte des risques de complications, telles que des saignements, des lésions de gros vaisseaux sanguins ou d'autres organes, ou des réactions à l'anesthésie. Bien que le risque de ces complications soit très faible lorsqu'une ablation d'une tumeur de Wilms est pratiquée par des chirurgiens expérimentés, elles restent des risques possibles.

Des douleurs post-opératoires peuvent survenir après une ablation d'une tumeur de Wilms. Cependant, ces douleurs peuvent être contrôlées par des médicaments.

Des risques plus rares, comme des hémorragies internes, des caillots sanguins et des infections, peuvent également survenir après une ablation d'une tumeur de Wilms. Ces risques sont communs à de nombreuses interventions chirurgicales.

En cas de tumeurs dans les deux reins, l'ablation complète des reins peut nécessiter une dialyse ou une greffe rénale.