Les endométriomes, souvent appelés kystes chocolat, ne se résolvent généralement pas spontanément. L'approche thérapeutique la plus efficace est l'ablation chirurgicale. Bien que certains médicaments puissent aider à gérer les symptômes et à ralentir la croissance des kystes, ils ne les éliminent généralement pas. Dans les cas où un kyste se rompt, son contenu peut se répandre dans la cavité abdominale. Cependant, si la paroi du kyste n'est pas entièrement excisée, le risque de récidive reste significativement élevé.