La procédure TEP/TDM FAPI est généralement indolore et n'occasionne qu'un inconfort minimal. Une sensation de piqûre légère et de courte durée peut être ressentie lors de l'injection du radiopharmaceutique. Tout au long du processus d'imagerie, les patients sont allongés confortablement et ne ressentent aucune douleur ni gêne.