L'orchite et l'épididymo-orchite peuvent devenir chroniques si elles ne sont pas traitées de manière opportune et adéquate. Dans les cas chroniques, des crises douloureuses et inflammatoires périodiques peuvent survenir. Une infection non traitée peut progresser vers la formation d'un abcès, nécessitant alors une intervention chirurgicale. En particulier chez les jeunes hommes, l'obstruction des canaux épididymaires causée par l'épididymite peut entraîner des dommages permanents et l'infertilité.