La réparation de la fente labiale vise fondamentalement à normaliser l'anatomie faciale. Reconnaissant le double rôle de la lèvre en tant qu'organe à la fois cosmétique et fonctionnel, la réparation doit méticuleusement aborder ces deux aspects. Le traitement englobe également les déformations nasales associées, qui sont presque universellement présentes dans les cas de fente labiale. Les objectifs spécifiques pour la lèvre incluent la reconstruction symétrique de la muqueuse et de la peau de la lèvre, assurant l'intégration fonctionnelle des muscles labiaux, et la formation esthétique des sous-unités labiales clés telles que les colonnes philtrales, le tubercule vermillon et l'arc de Cupidon. Pour le nez, les objectifs du traitement impliquent l'obtention de narines symétriques, d'un plancher nasal adéquat, d'une longueur de columelle appropriée, d'une projection de la pointe nasale symétrique et suffisante, et de bases alaires symétriques.
Les objectifs du traitement de la fente palatine sont tout aussi exhaustifs. Ceux-ci comprennent l'établissement d'une valve vélopharyngée étanche à l'air et à l'eau, la préservation de l'ouïe, le maintien d'une croissance normale du milieu du visage, la création d'une arcade dentaire supérieure fonctionnellement et esthétiquement adéquate, et finalement la facilitation d'une élocution claire et d'une phonation optimale.