La chondromalacie patellaire résulte principalement de perturbations dans le mécanisme de glissement de la rotule. Ces dysfonctionnements de mouvement peuvent provenir de désalignements osseux congénitaux ou développementaux. De plus, des déséquilibres musculaires, tels qu'une faiblesse des quadriceps ou des ischio-jambiers, ou un déséquilibre entre les muscles internes et externes de la cuisse, peuvent entraîner un mouvement rotulien inapproprié. Les facteurs contributifs spécifiques incluent souvent une tension excessive de la bandelette ilio-tibiale sur la cuisse externe et une faiblesse du vaste médial oblique (VMO), la partie interne du muscle quadriceps. Un stress répétitif sur la rotule dû à des activités comme la course, le saut ou le ski, ainsi qu'un traumatisme aigu au genou, sont également des causes fréquentes de chondromalacie patellaire.