Le diagnostic de la prostatite infectieuse est généralement établi par culture d'urine. Au cours du processus diagnostique, des échantillons d'urine peuvent être prélevés avant et après un examen de la prostate afin d'aider à déterminer la localisation de l'infection. De plus, des analyses sanguines peuvent être demandées pour évaluer les marqueurs inflammatoires ou une infection systémique.