Kalbin gelişimi anne karnında ilk 6-10 hafta arasında gerçekleşir. Bu, bir kadın hamile olduğunu öğrendiğinde bebeğinin kalbinin neredeyse tamamen oluşmuş olduğu anlamına gelir. Gebeliğin ilk 10 haftasında maruz kalınan olumsuz etkenler, doğuştan kalp hastalıklarının gelişmesine neden olabilir. Genetik yatkınlığı olan bir bebekte bu dönemde enfeksiyon, radyasyon, elektromanyetik alan, ilaç veya diğer zararlı maddeler (alkol, uyuşturucu, hava kirliliği vb.), annenin yetersiz beslenmesi, Fallot tetralojisi gibi doğuştan kalp hastalıklarını oluşturabilecek risk faktörleridir. Ancak bu konuda kesin ve kanıta dayalı tam bir bilgi mevcut değildir. Hastalığın oluşumu multifaktöriyeldir, yani birçok faktörün bir araya gelmesiyle gerçekleşir.