Das deutlichste Anzeichen der Anisokorie ist eine ungleiche Pupillengröße. In manchen Fällen ist dies das einzige Symptom, während im Verlauf der Erkrankung unscharfes Sehen, Doppeltsehen oder plötzlicher Sehverlust auftreten können. Die Symptome einer Anisokorie können wie folgt aufgelistet werden:

Augenschmerzen
Unscharfes Sehen
Doppeltsehen (Diplopie)
Lichtempfindlichkeit (Photophobie)
Plötzlicher Sehverlust
Kopfschmerzen
Fieber
Übelkeit oder Erbrechen
Nackenschmerzen oder Nackenstarre