Die Behandlung der Polyzythämie variiert je nach der zugrunde liegenden Ursache. Zum Beispiel hilft bei sekundärer Polyzythämie, die durch obstruktive Schlafapnoe verursacht wird, die Behandlung der primären Ursache, die Anzahl der roten Blutkörperchen zu normalisieren und zu reduzieren. Für die primäre Polyzythämie, insbesondere die Polyzythämie Vera (PV), gibt es jedoch keine bekannte Heilung. In solchen Fällen zielt die Behandlung darauf ab, die Anzahl der roten Blutkörperchen effektiv zu kontrollieren und das Risiko schwerwiegender Komplikationen, wie Blutgerinnsel, zu minimieren.