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Während der Untersuchung kann es aufgrund der dem Baby verabreichten Augentropfen zu leichtem Fieber kommen. Darüber hinaus können, da Säuglinge während des Eingriffs Stress ausgesetzt sein können, vorübergehende Atemprobleme auftreten. Aufgrund dieser Risiken werden insbesondere Hochrisiko-Säuglinge in neonatologischen Intensivstationen genau überwacht.