Лечение паралича диафрагмы начинается с всесторонней оценки общего состояния здоровья пациента, степени влияния одышки на его качество жизни и любых основных причин паралича. Если выявляется первичная причина, приводящая к параличу, лечение в первую очередь направлено на ее устранение. При одностороннем параличе диафрагмы может быть применена пликация диафрагмы (хирургическое подтягивание купола диафрагмы). В случаях двустороннего паралича диафрагмы, если результаты ЭМГ диафрагмального нерва показывают, что нервы интактны, может быть рассмотрена терапия диафрагмальным стимулятором. При этом методе обычно по два электрода устанавливаются на каждую диафрагму. Эти электроды выводятся из брюшной области и подключаются к стимулятору. Устройство посылает электрические импульсы к мышцам диафрагмы через заданные интервалы, вызывая их сокращение и, таким образом, обеспечивая их механическое участие в дыхании. Пациентам, которым не удается обеспечить достаточную респираторную поддержку после всех хирургических вмешательств, для поддержания дыхания может потребоваться поддержка механическим вентилятором.