O diagnóstico de epididimite é tipicamente estabelecido através de um exame físico. Um exame retal digital pode ser realizado para avaliar o aumento ou a sensibilidade prostática. Se houver secreção uretral, uma amostra pode ser coletada para análise laboratorial a fim de rastrear infecções sexualmente transmissíveis como gonorreia e clamídia. Amostras de urina e sangue são analisadas para quaisquer anormalidades. O ultrassom Doppler colorido pode ser utilizado para avaliar o fluxo sanguíneo para os testículos, o que ajuda a confirmar o diagnóstico de epididimite identificando quaisquer desvios do fluxo sanguíneo normal.