A epididimite é mais comumente caracterizada por dor na região da virilha, que pode ser acompanhada por inchaço e aumento da temperatura. Tipicamente, a dor e a sensibilidade testicular unilateral desenvolvem-se gradualmente. Se a epididimite for causada por uma infecção do trato urinário, os sintomas podem incluir micção dolorosa ou uma necessidade frequente e urgente de urinar. Nos casos em que a condição resulta de uma infecção sexualmente transmissível, os pacientes podem apresentar corrimento peniano colorido, sangue no sêmen ou dor e desconforto na parte inferior do abdômen. A febre é um sintoma incomum. A epididimite é considerada crônica se durar mais de seis semanas ou se recorrer. Os sintomas da epididimite crônica podem surgir lentamente e, ocasionalmente, a sua causa subjacente não pode ser identificada.