स्पर्मेटिक कॉर्ड सिस्ट सर्जरी में आमतौर पर जटिलताओं की दर कम होती है। संभावित जटिलताओं में शामिल हो सकते हैं: सर्जरी के दौरान स्पर्मेटिक कॉर्ड को चोट या टूटना। सर्जिकल क्षेत्र या अंडकोश में हेमेटोमा (रक्त का जमाव) का विकास। वृषण को रक्त की आपूर्ति के लिए जिम्मेदार संवहनी संरचनाओं को क्षति या टूटना। शल्य चिकित्सा से बंद किए गए वंक्षण नहरों का फिर से खुलना (पुनरावृत्ति) या अपर्याप्त बंधन। सर्जरी के बावजूद सिस्ट का फिर से होना (पुनरावृत्ति)। जटिलताओं के जोखिम को कम करने और सर्वोत्तम परिणाम प्राप्त करने के लिए इन ऑपरेशनों को पूरी तरह सुसज्जित अस्पतालों में अनुभवी सर्जनों द्वारा किया जाना अत्यंत महत्वपूर्ण है।