यदि किसी डॉक्टर को पेनिस कैंसर का संदेह होता है, तो वे निश्चित निदान के लिए बायोप्सी की सिफारिश करेंगे। बायोप्सी में प्रयोगशाला में विस्तृत जांच के लिए पेनिस या लिम्फ नोड्स से ऊतक का एक छोटा नमूना लेना शामिल है। इस प्रक्रिया का उद्देश्य कैंसर कोशिकाओं की उपस्थिति और प्रकार की पुष्टि करना है। आम तौर पर, बायोप्सी के तीन मुख्य प्रकार उपलब्ध हैं: चीरा बायोप्सी (Incisional biopsy): इस विधि में, असामान्य दिखने वाले ऊतक का केवल एक हिस्सा शल्य चिकित्सा द्वारा हटाया जाता है। यह आमतौर पर बड़े घावों, चोटों, अल्सर या उन घावों के लिए लागू किया जाता है जो ऊतक में गहराई तक फैल गए हों।