कोक्लियर इम्प्लांट सर्जरी आमतौर पर एक सुरक्षित और अच्छी तरह से सहन की जाने वाली प्रक्रिया है, जब इसे विशेषज्ञ सर्जनों द्वारा पूरी तरह सुसज्जित स्वास्थ्य सुविधाओं में किया जाता है। हालांकि, किसी भी सर्जिकल हस्तक्षेप की तरह, कुछ जोखिम शायद ही कभी हो सकते हैं। ये संभावित जोखिम आमतौर पर हल्के होते हैं और इनमें शामिल हो सकते हैं: रक्तस्राव, सूजन, इम्प्लांट साइट पर संक्रमण, टिनिटस (कान में बजना), कान के आसपास सुन्नता, चक्कर आना, स्वाद में बदलाव और मुंह का सूखना। जब गैर-विशेषज्ञों द्वारा या अनुचित परिस्थितियों में किया जाता है, तो फेशियल तंत्रिका की चोट, सेरेब्रोस्पाइनल द्रव के रिसाव और मेनिन्जाइटिस जैसी अधिक गंभीर जटिलताओं का जोखिम बढ़ जाता है। इसके अलावा, रोगी के सामान्य स्वास्थ्य स्थिति और चिकित्सा इतिहास के आधार पर अतिरिक्त जोखिम भी उत्पन्न हो सकते हैं।