एंडोमेट्रियोसिस, जिसे अक्सर 'चॉकलेट सिस्ट' कहा जाता है, एक ऐसी स्थिति है जिसका सटीक कारण अभी भी अज्ञात है। सबसे व्यापक रूप से स्वीकृत सिद्धांत प्रतिगामी मासिक धर्म को प्राथमिक कारण बताता है। मासिक धर्म के दौरान, कुछ एंडोमेट्रियल ऊतक, शरीर से बाहर निकलने के बजाय, फैलोपियन ट्यूब के माध्यम से श्रोणि गुहा और शरीर के अन्य क्षेत्रों में पीछे की ओर प्रवाहित होता है। एंडोमेट्रियोसिस तब होता है जब ये विस्थापित ऊतक गर्भाशय के बाहर प्रत्यारोपित और विकसित होते हैं।

यह रोग संबंधी वृद्धि मासिक धर्म के दौरान पेट के निचले हिस्से में गंभीर दर्द जैसे लक्षणों के साथ प्रकट हो सकती है, जिसके साथ अक्सर भारी योनि से रक्तस्राव होता है।

एंडोमेट्रियोसिस के विकास में कई कारकों का योगदान माना जाता है:
* प्रतिगामी मासिक धर्म
* आनुवंशिक प्रवृत्ति
* प्रतिरक्षा प्रणाली की शिथिलता
* एस्ट्रोजन हार्मोन असंतुलन
* सिजेरियन या हिस्टेरेक्टॉमी जैसे सर्जिकल हस्तक्षेप।