एक्यूट मायलोइड ल्यूकेमिया (एएमएल) के रोगियों में स्टेम सेल प्रत्यारोपण किसे और कैसे किया जाता है, यह रोगी के जोखिम समूह द्वारा निर्धारित होता है। रोगियों को उनके आनुवंशिक उत्परिवर्तन और क्रोमोसोमल असामान्यताओं के आधार पर कम, मध्यम और उच्च जोखिम वाले समूहों में वर्गीकृत किया जाता है। कम जोखिम वाले समूह के रोगियों के लिए स्टेम सेल प्रत्यारोपण को आम तौर पर प्राथमिकता नहीं दी जाती है। इन रोगियों को मुख्य रूप से कीमोथेरेपी और समेकन (कंसोलिडेशन) उपचार दिए जाते हैं। इन समूहों में, जहाँ बीमारी का संभावित रूप से अनुकूल पाठ्यक्रम होता है, प्रत्यारोपण से जुड़े गंभीर जटिलताओं के जोखिमों से बचने के लिए स्टेम सेल प्रत्यारोपण को टाला जा सकता है। मध्यम और उच्च जोखिम वाले समूहों के रोगियों पर स्टेम सेल प्रत्यारोपण के लिए तभी विचार किया जाता है जब बीमारी में छूट (रेमिशन) प्राप्त हो जाती है।