Le succès du traitement du spina-bifida est directement lié à la gravité de l'affection et au degré d'atteinte des nerfs. Dans les cas où les nerfs sont endommagés au point de perdre complètement leur fonction, il n'est généralement pas possible de revenir sur ces dommages. Dans de tels cas, l'objectif principal du traitement est de préserver les fonctions existantes au niveau le plus élevé possible et de prévenir les complications potentielles. Après l'intervention chirurgicale qui referme le système nerveux pour le protéger des infections, des traitements de soutien adaptés aux besoins spécifiques du patient sont mis en œuvre. Ces traitements comprennent la physiothérapie pour la faiblesse musculaire, des traitements orthopédiques correctifs pour les problèmes orthopédiques, et des thérapies visant à améliorer le contrôle de la vessie et des intestins. Bien que certains problèmes puissent ne pas être apparents au début, ils peuvent apparaître comme des problèmes secondaires au fil du temps. Des exemples incluent le syndrome de la moelle épinière attachée (tethered cord syndrome), la scoliose ou la cyphose pouvant se développer pendant la croissance, et les déformations des pieds. Un traitement et des interventions supplémentaires peuvent être nécessaires pour la gestion de ces conditions secondaires.