L'épididymite non traitée peut entraîner de graves complications, telles que la formation d'un abcès. Dans les cas sévères, l'abcès formé peut se drainer à travers la peau. Bien que rare, l'épididymite peut également affecter négativement la fertilité. Un diagnostic et un traitement précoces sont essentiels pour prévenir ces problèmes potentiels.