La coloscopie est une procédure réalisée après obtention du consentement du patient. Cependant, dans certaines situations, en tenant compte de la sécurité et de la santé du patient, il peut être conseillé de reporter ou de ne pas effectuer de coloscopie. Ces situations incluent principalement : une préparation intestinale insuffisante, un risque élevé de perforation intestinale, une inflammation intestinale sévère, une péritonite (inflammation du péritoine) et les patients présentant un risque élevé de crise cardiaque.