La complicación más común de la enfermedad de manos, pies y boca es la deshidratación. La enfermedad puede causar lesiones dolorosas en la boca y la garganta, lo que dificulta la deglución. Por lo tanto, es crucial para los pacientes, especialmente los niños, mantener una ingesta adecuada de líquidos para prevenir la deshidratación. En casos de deshidratación grave, puede ser necesaria la terapia con líquidos intravenosos (IV) en un entorno hospitalario.

Aunque la enfermedad de manos, pies y boca suele ser una enfermedad leve, en raras ocasiones puede dar lugar a complicaciones graves. Los enterovirus que causan la enfermedad pueden, en algunos casos, llegar al sistema nervioso central y provocar afecciones que ponen en peligro la vida. Estas posibles complicaciones graves incluyen:

* Meningitis viral: Esta es una infección e inflamación de las membranas (meninges) que rodean el cerebro y la médula espinal, y del líquido cefalorraquídeo.
* Encefalitis: Una condición grave y potencialmente mortal que implica la inflamación del cerebro.